BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB009E05LP1|AL426044
(859 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1566 1668 0.0
3x_Contig1138 866 0.0
3x_Contig1302 804 0.0
>3x_Contig1566
Length = 10355
Score = 1668 bits (840), Expect = 0.0
Identities = 848/850 (99%), Gaps = 1/850 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 10 aaatcaccatcagctatcatactgaataacaagcaatcaagctaaaaagaatatcaatat 69
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7984 aaatcaccatcagctatcatactgaataacaagcaatcaagctaaaaagaatatcaatat 7925
Query: 70 taattaaaaaatgtccattcctgaaactcaaaagggtgttatcttttacgaaaacggtgg 129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7924 taattaaaaaatgtccattcctgaaactcaaaagggtgttatcttttacgaaaacggtgg 7865
Query: 130 tgaattgcaatacaaggacattccagttccaaagccaaaggccaacgaacttttgatcaa 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7864 tgaattgcaatacaaggacattccagttccaaagccaaaggccaacgaacttttgatcaa 7805
Query: 190 cgtcaagtactccggtgtctgtcacaccgatttgcacgcatggragggtgactggccttt 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 7804 cgtcaagtactccggtgtctgtcacaccgatttgcacgcatggaagggtgactggccttt 7745
Query: 250 gccaaccaaattgccattagttggtggtcacgaaggtgctggtgtcgttgttgctatggg 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7744 gccaaccaaattgccattagttggtggtcacgaaggtgctggtgtcgttgttgctatggg 7685
Query: 310 tgaaaatgtcaagggctggaacattggtgactttgctggtatcaaatggttgaacggttc 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7684 tgaaaatgtcaagggctggaacattggtgactttgctggtatcaaatggttgaacggttc 7625
Query: 370 ttgtatgtcctgtgaatactgtgaattgtccaatgaatccaactgtcccgatgctgactt 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7624 ttgtatgtcctgtgaatactgtgaattgtccaatgaatccaactgtcccgatgctgactt 7565
Query: 430 gtctggttacacccacgatggttctttccaacaatatgctaccgctgatgccgttcaagc 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7564 gtctggttacacccacgatggttctttccaacaatatgctaccgctgatgccgttcaagc 7505
Query: 490 tgctagaattccaaagggtaccgagtttggctgaagttgctccaattctatgtgccggtg 549
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7504 tgctagaattccaaagggtaccga-tttggctgaagttgctccaattctatgtgccggtg 7446
Query: 550 ttaccgtttacaaggctctaaaatctgctgacttgaaggccggtgactgggttgccattt 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7445 ttaccgtttacaaggctctaaaatctgctgacttgaaggccggtgactgggttgccattt 7386
Query: 610 ccggtgcctgtggtggtctaggttctttggctatccaatacgccaaggctatgggttaca 669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7385 ccggtgcctgtggtggtctaggttctttggctatccaatacgccaaggctatgggttaca 7326
Query: 670 gagtcttgggtattgataccggtgctgaaaaggctaagttgttcaaggagctaggtggtg 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7325 gagtcttgggtattgataccggtgctgaaaaggctaagttgttcaaggagctaggtggtg 7266
Query: 730 aatacttcgtcgattatgccgtctctaaggatttgattaaagaaattgttgacgctacta 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7265 aatacttcgtcgattatgccgtctctaaggatttgattaaagaaattgttgacgctacta 7206
Query: 790 acggtggtgcccacggtgtcattaacgtctctgtctccgaatttgctatagaacaatcca 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 7205 acggtggtgcccacggtgtcattaacgtctctgtctccgaatttgctatagaacaatcca 7146
Query: 850 ccaattacgt 859
||||||||||
Sbjct: 7145 ccaattacgt 7136
>3x_Contig1138
Length = 5524
Score = 866 bits (436), Expect = 0.0
Identities = 594/646 (91%), Gaps = 1/646 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 92 gaaactcaaaagggtgttatcttttacgaaaacggtggtgaattgcaatacaaggacatt 151
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4854 gaaactcaaaagggtgttatcttctacgaaaacggtggtgaattgcaatacaaggacatc 4795
Query: 152 ccagttccaaagccaaaggccaacgaacttttgatcaacgtcaagtactccggtgtctgt 211
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4794 ccagttccaaagccaaaggctaacgaacttttgatcaacgtcaagtactccggtgtctgt 4735
Query: 212 cacaccgatttgcacgcatggragggtgactggcctttgccaaccaaattgccattagtt 271
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4734 cacaccgatttgcacgcatggaagggtgactggcctttgccaaccaaattgccattagtt 4675
Query: 272 ggtggtcacgaaggtgctggtgtcgttgttgctatgggtgaaaatgtcaagggctggaac 331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 4674 ggtggtcacgaaggtgctggtgtcgttgttgctatgggtgaaaacgtcaagggctggaag 4615
Query: 332 attggtgactttgctggtatcaaatggttgaacggttcttgtatgtcctgtgaatactgt 391
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4614 attggtgacttcgctggtatcaaatggttgaacggttcttgtatgtcctgtgaatactgt 4555
Query: 392 gaattgtccaatgaatccaactgtcccgatgctgacttgtctggttacacccacgatggt 451
||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct: 4554 gaattgtccaacgaatccaactgtccagaagctgacttgtccggttacactcacgacggt 4495
Query: 452 tctttccaacaatatgctaccgctgatgccgttcaagctgctagaattccaaagggtacc 511
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | || ||| |||||
Sbjct: 4494 tctttccaacaatacgctactgctgatgccgttcaagctgccaagatcccagtcggtact 4435
Query: 512 gagtttggctgaagttgctccaattctatgtgccggtgttaccgtttacaaggctctaaa 571
|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct: 4434 ga-cttggctgaagttgctccagtgctatgtgctggtgtcaccgtttacaaggccctaaa 4376
Query: 572 atctgctgacttgaaggccggtgactgggttgccatttccggtgcctgtggtggtctagg 631
||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||
Sbjct: 4375 atccgccaacttgaaggccggtgactgggtcgccatctctggtgctgctggtggtctagg 4316
Query: 632 ttctttggctatccaatacgccaaggctatgggttacagagtcttgggtattgataccgg 691
|||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||
Sbjct: 4315 ttctctagctgtccaatacgccaaggccatgggttacagagtgttgggtatcgatgctgg 4256
Query: 692 tgctgaaaaggctaagttgttcaaggagctaggtggtgaatacttc 737
|| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct: 4255 tgaagaaaaggctaagttgttcaaggacttgggtggtgaatacttc 4210
>3x_Contig1302
Length = 5215
Score = 804 bits (405), Expect = 0.0
Identities = 539/583 (92%), Gaps = 1/583 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 92 gaaactcaaaagggtgttatcttttacgaaaacggtggtgaattgcaatacaaggacatt 151
||||| |||||||||||||| || || || || |||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct: 2313 gaaacccaaaagggtgttattttctatgagaatggtggtaaattggaatacaaggacatt 2254
Query: 152 ccagttccaaagccaaaggccaacgaacttttgatcaacgtcaagtactccggtgtctgt 211
|||||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 2253 ccagttccaaagccaaagccaaatgaaatcttgatcaacgtcaagtactccggtgtgtgt 2194
Query: 212 cacaccgatttgcacgcatggragggtgactggcctttgccaaccaaattgccattagtt 271
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct: 2193 cataccgatttgcacgcatggaagggtgactggccattgccaaccaagttgccattggtc 2134
Query: 272 ggtggtcacgaaggtgctggtgtcgttgttgctatgggtgaaaatgtcaagggctggaac 331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 2133 ggtggtcacgaaggtgctggtgtcgttgttgctatgggtgaaaacgtcaagggctggaac 2074
Query: 332 attggtgactttgctggtatcaaatggttgaacggttcttgtatgtcctgtgaatactgt 391
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2073 attggtgactttgcgggtatcaaatggttgaacggttcttgtatgtcctgtgaatactgt 2014
Query: 392 gaattgtccaatgaatccaactgtcccgatgctgacttgtctggttacacccacgatggt 451
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2013 gaattgtccaatgaatccaactgtccagatgctgacttgtctggttacacccacgatggt 1954
Query: 452 tctttccaacaatatgctaccgctgatgccgttcaagctgctagaattccaaagggtacc 511
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1953 tctttccaacaatacgctaccgcagatgctgttcaagctgccagaattccaaagggtacc 1894
Query: 512 gagtttggctgaagttgctccaattctatgtgccggtgttaccgtttacaaggctctaaa 571
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||
Sbjct: 1893 ga-tttggctgaagttgctccaattctatgtgccggtgttactgtttacaaggctttgaa 1835
Query: 572 atctgctgacttgaaggccggtgactgggttgccatttccggtgcctgtggtggtctagg 631
| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||
Sbjct: 1834 aagtgctaacttgaaggctggtgactgggttgccatctctggtgctgctggtggtctagg 1775
Query: 632 ttctttggctatccaatacgccaaggctatgggttacagagtc 674
|||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1774 ttctctagctgtccaatacgccaaggccatgggttacagagtc 1732
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 5834
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 5834
Number of successful extensions: 53
Number of sequences better than 1.0e-20: 3
length of query: 859
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 843
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 8707885677
effective search space used: 8707885677
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.8 bits)